Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f3O35261 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f3O35261 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f3O35261 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f3O35261 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f3O35261 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
E2f3O35261 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f3O35261 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f3O35261 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f3O35261 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f3O35261 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f3O35261 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms