Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pkd2O35245 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pkd2O35245 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Pkd2O35245 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pkd2O35245 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pkd2O35245 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms