Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
POLR2DO15514 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR2DO15514 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2DO15514 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms