Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GNPATO15228 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GNPATO15228 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GNPATO15228 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GNPATO15228 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GNPATO15228 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GNPATO15228 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GNPATO15228 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GNPATO15228 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GNPATO15228 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GNPATO15228 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GNPATO15228 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GNPATO15228 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GNPATO15228 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GNPATO15228 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GNPATO15228 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GNPATO15228 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GNPATO15228 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GNPATO15228 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
GNPATO15228 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GNPATO15228 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GNPATO15228 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GNPATO15228 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GNPATO15228 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GNPATO15228 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GNPATO15228 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GNPATO15228 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GNPATO15228 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GNPATO15228 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GNPATO15228 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GNPATO15228 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GNPATO15228 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GNPATO15228 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GNPATO15228 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GNPATO15228 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GNPATO15228 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
GNPATO15228 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GNPATO15228 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GNPATO15228 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GNPATO15228 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.73
GNPATO15228 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
GNPATO15228 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GNPATO15228 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GNPATO15228 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GNPATO15228 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GNPATO15228 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GNPATO15228 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GNPATO15228 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GNPATO15228 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GNPATO15228 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GNPATO15228 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GNPATO15228 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GNPATO15228 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GNPATO15228 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GNPATO15228 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GNPATO15228 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GNPATO15228 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GNPATO15228 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GNPATO15228 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GNPATO15228 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GNPATO15228 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GNPATO15228 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GNPATO15228 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GNPATO15228 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GNPATO15228 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GNPATO15228 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GNPATO15228 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GNPATO15228 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GNPATO15228 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GNPATO15228 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GNPATO15228 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
GNPATO15228 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GNPATO15228 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GNPATO15228 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GNPATO15228 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GNPATO15228 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GNPATO15228 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GNPATO15228 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GNPATO15228 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GNPATO15228 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GNPATO15228 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
GNPATO15228 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GNPATO15228 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
GNPATO15228 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GNPATO15228 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GNPATO15228 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GNPATO15228 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GNPATO15228 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GNPATO15228 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GNPATO15228 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GNPATO15228 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GNPATO15228 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GNPATO15228 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GNPATO15228 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GNPATO15228 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GNPATO15228 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GNPATO15228 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GNPATO15228 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GNPATO15228 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GNPATO15228 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms