Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP290O15078 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP290O15078 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP290O15078 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP290O15078 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP290O15078 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP290O15078 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP290O15078 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP290O15078 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP290O15078 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP290O15078 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP290O15078 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP290O15078 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP290O15078 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP290O15078 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP290O15078 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP290O15078 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP290O15078 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP290O15078 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP290O15078 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP290O15078 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP290O15078 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP290O15078 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP290O15078 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP290O15078 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP290O15078 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP290O15078 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP290O15078 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP290O15078 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP290O15078 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP290O15078 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP290O15078 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP290O15078 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP290O15078 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP290O15078 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP290O15078 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP290O15078 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP290O15078 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP290O15078 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP290O15078 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP290O15078 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP290O15078 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP290O15078 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP290O15078 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP290O15078 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP290O15078 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP290O15078 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP290O15078 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP290O15078 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP290O15078 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP290O15078 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP290O15078 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP290O15078 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP290O15078 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP290O15078 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP290O15078 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP290O15078 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP290O15078 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CEP290O15078 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP290O15078 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP290O15078 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP290O15078 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP290O15078 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP290O15078 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP290O15078 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP290O15078 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP290O15078 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP290O15078 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP290O15078 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP290O15078 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP290O15078 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP290O15078 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP290O15078 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP290O15078 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP290O15078 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP290O15078 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP290O15078 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP290O15078 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP290O15078 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP290O15078 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP290O15078 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP290O15078 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP290O15078 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP290O15078 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP290O15078 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CEP290O15078 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CEP290O15078 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CEP290O15078 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CEP290O15078 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CEP290O15078 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CEP290O15078 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CEP290O15078 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CEP290O15078 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CEP290O15078 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CEP290O15078 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CEP290O15078 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CEP290O15078 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CEP290O15078 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CEP290O15078 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CEP290O15078 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms