Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IKBKBO14920 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IKBKBO14920 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IKBKBO14920 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms