Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCKDKO14874 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDKO14874 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms