Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDC80O14777 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDC80O14777 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDC80O14777 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDC80O14777 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDC80O14777 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDC80O14777 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDC80O14777 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDC80O14777 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDC80O14777 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDC80O14777 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDC80O14777 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDC80O14777 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDC80O14777 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDC80O14777 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDC80O14777 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NDC80O14777 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDC80O14777 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDC80O14777 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDC80O14777 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDC80O14777 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDC80O14777 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDC80O14777 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDC80O14777 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NDC80O14777 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDC80O14777 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDC80O14777 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDC80O14777 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDC80O14777 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NDC80O14777 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC80O14777 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC80O14777 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC80O14777 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC80O14777 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC80O14777 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC80O14777 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC80O14777 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC80O14777 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDC80O14777 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDC80O14777 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NDC80O14777 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDC80O14777 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDC80O14777 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NDC80O14777 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDC80O14777 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDC80O14777 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDC80O14777 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDC80O14777 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDC80O14777 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDC80O14777 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDC80O14777 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NDC80O14777 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDC80O14777 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDC80O14777 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDC80O14777 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDC80O14777 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDC80O14777 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDC80O14777 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDC80O14777 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDC80O14777 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NDC80O14777 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDC80O14777 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC80O14777 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC80O14777 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC80O14777 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC80O14777 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC80O14777 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC80O14777 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC80O14777 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDC80O14777 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDC80O14777 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDC80O14777 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDC80O14777 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDC80O14777 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDC80O14777 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDC80O14777 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NDC80O14777 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDC80O14777 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDC80O14777 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDC80O14777 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NDC80O14777 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDC80O14777 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDC80O14777 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDC80O14777 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDC80O14777 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDC80O14777 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDC80O14777 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDC80O14777 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDC80O14777 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDC80O14777 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDC80O14777 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDC80O14777 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDC80O14777 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDC80O14777 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDC80O14777 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDC80O14777 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDC80O14777 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDC80O14777 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC80O14777 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC80O14777 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms