Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBFD1O14562 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBFD1O14562 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBFD1O14562 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBFD1O14562 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms