Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hdac1O09106 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac1O09106 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac1O09106 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac1O09106 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms