Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eftud2O08810 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eftud2O08810 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms