Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dctn1O08788 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dctn1O08788 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dctn1O08788 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dctn1O08788 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Dctn1O08788 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dctn1O08788 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms