Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec22bO08547 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec22bO08547 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sec22bO08547 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms