Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PIK3C2BO00750 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PIK3C2BO00750 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PIK3C2BO00750 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PIK3C2BO00750 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PIK3C2BO00750 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PIK3C2BO00750 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PIK3C2BO00750 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PIK3C2BO00750 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PIK3C2BO00750 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PIK3C2BO00750 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PIK3C2BO00750 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms