Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.514e-12■■■■■ 59.4
DDX3XO00571 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.558e-17■■■■■ 59.3
DDX3XO00571 SMIM19-205ENST00000490331 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.998e-17■■■■■ 59.3
DDX3XO00571 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.933e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.513e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.483e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 SKP2-205ENST00000509692 1646 ntTSL 217.18■□□□□ 0.343e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 SKP2-202ENST00000274255 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.443e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 SKP2-207ENST00000513263 694 ntTSL 210.91□□□□□ -0.663e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 SKP2-206ENST00000513151 901 ntTSL 39.3□□□□□ -0.923e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.421e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.821e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 AGTRAP-209ENST00000476512 942 ntTSL 318.09■□□□□ 0.491e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.381e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 516.69■□□□□ 0.261e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-12■■■■■ 59.2
DDX3XO00571 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.193e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.763e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-212ENST00000543318 1429 ntTSL 1 (best)25.46■■□□□ 1.673e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.443e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.233e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-213ENST00000543430 1436 ntTSL 522.24■■□□□ 1.153e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.893e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-214ENST00000543984 1612 ntTSL 220.31■□□□□ 0.843e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.548e-14■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 TDRG1-201ENST00000373170 1165 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.283e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.263e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 NDUFAF5-201ENST00000378081 2409 ntTSL 216.65■□□□□ 0.263e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 NDUFAF5-210ENST00000477732 552 ntTSL 516.46■□□□□ 0.233e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 NDUFAF5-214ENST00000485738 718 ntTSL 515.99■□□□□ 0.153e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-209ENST00000541187 823 ntTSL 315.1■□□□□ 0.013e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -08e-14■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-205ENST00000499638 3145 ntTSL 214.75□□□□□ -0.053e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-210ENST00000542067 1084 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.123e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 NDUFAF5-206ENST00000475968 933 ntTSL 513.17□□□□□ -0.33e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 NDUFAF5-213ENST00000481249 676 ntTSL 513.17□□□□□ -0.33e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 NDUFAF5-202ENST00000378106 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 TDRG1-203ENST00000448559 741 ntTSL 211.07□□□□□ -0.643e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 TDRG1-204ENST00000451810 919 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.723e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-208ENST00000540930 545 ntTSL 58.79□□□□□ -13e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-206ENST00000538417 866 ntTSL 38.53□□□□□ -1.043e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.143e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 P2RX4-207ENST00000538701 451 ntTSL 56.69□□□□□ -1.343e-13■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 GCC1-203ENST00000497650 795 ntTSL 39.97□□□□□ -0.819e-7■■■■■ 58.8
DDX3XO00571 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.821e-9■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 BAMBI-202ENST00000497699 1884 ntTSL 221.92■■□□□ 1.11e-9■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.532e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 CHRNB1-206ENST00000574054 583 ntTSL 221.3■■□□□ 12e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 CHRNB1-204ENST00000572857 539 ntTSL 421.1■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 PNPLA6-222ENST00000601001 866 ntTSL 320.74■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 PNPLA6-223ENST00000601668 753 ntTSL 320.74■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 PNPLA6-208ENST00000594754 989 ntTSL 420.68■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 PNPLA6-206ENST00000594098 505 ntTSL 215.16■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 NECTIN1-205ENST00000524510 832 ntTSL 513.21□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 58.7
DDX3XO00571 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.893e-14■■■■■ 58.6
DDX3XO00571 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.613e-14■■■■■ 58.6
DDX3XO00571 MRPS24-204ENST00000467084 729 ntTSL 215.17■□□□□ 0.023e-14■■■■■ 58.6
DDX3XO00571 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-14■■■■■ 58.6
DDX3XO00571 CRELD2-208ENST00000482956 855 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 58.5
DDX3XO00571 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.88e-11■■■■■ 58.5
DDX3XO00571 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.628e-11■■■■■ 58.5
DDX3XO00571 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.598e-11■■■■■ 58.5
DDX3XO00571 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.931e-22■■■■■ 58.4
DDX3XO00571 CDC40-202ENST00000368930 1977 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.477e-12■■■■■ 58.4
DDX3XO00571 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.127e-12■■■■■ 58.4
DDX3XO00571 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.167e-12■■■■■ 58.4
DDX3XO00571 CDC40-207ENST00000606893 3372 ntTSL 27.39□□□□□ -1.237e-12■■■■■ 58.4
DDX3XO00571 TMEM164-208ENST00000497754 236 ntTSL 222.09■■□□□ 1.131e-8■■■■■ 58.3
DDX3XO00571 TMEM164-207ENST00000471255 418 ntTSL 317.73■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 58.3
DDX3XO00571 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 58.3
DDX3XO00571 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.793e-9■■■■■ 58.2
DDX3XO00571 ECHDC3-205ENST00000496136 1767 ntTSL 1 (best)23.11■■□□□ 1.293e-9■■■■■ 58.2
DDX3XO00571 ECHDC3-202ENST00000420401 854 ntTSL 218.81■□□□□ 0.63e-9■■■■■ 58.2
DDX3XO00571 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.318e-17■■■■■ 58.1
DDX3XO00571 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.28e-17■■■■■ 58.1
DDX3XO00571 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 220.46■□□□□ 0.878e-17■■■■■ 58.1
DDX3XO00571 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.511e-20■■■■■ 57.8
DDX3XO00571 COPRS-205ENST00000579984 422 ntTSL 323.45■■□□□ 1.341e-20■■■■■ 57.8
DDX3XO00571 COPRS-203ENST00000496655 1062 ntTSL 1 (best)22.78■■□□□ 1.241e-20■■■■■ 57.8
DDX3XO00571 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.666e-20■■■■■ 57.8
DDX3XO00571 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 218.02■□□□□ 0.486e-20■■■■■ 57.8
DDX3XO00571 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 57.6
DDX3XO00571 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.371e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.291e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.271e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-223ENST00000640726 1636 ntTSL 522.79■■□□□ 1.241e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.191e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-202ENST00000370155 2454 ntTSL 522.41■■□□□ 1.181e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-211ENST00000638876 1005 ntTSL 522.2■■□□□ 1.141e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.091e-36■■■■■ 57.3
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