Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3FO00303 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3FO00303 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3FO00303 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms