Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP1O00294 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP1O00294 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP1O00294 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP1O00294 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP1O00294 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TULP1O00294 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TULP1O00294 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TULP1O00294 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TULP1O00294 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP1O00294 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP1O00294 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TULP1O00294 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP1O00294 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP1O00294 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP1O00294 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP1O00294 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP1O00294 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP1O00294 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP1O00294 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP1O00294 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP1O00294 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP1O00294 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP1O00294 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP1O00294 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP1O00294 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP1O00294 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP1O00294 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP1O00294 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP1O00294 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP1O00294 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP1O00294 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP1O00294 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP1O00294 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TULP1O00294 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TULP1O00294 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TULP1O00294 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP1O00294 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP1O00294 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP1O00294 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP1O00294 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP1O00294 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP1O00294 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP1O00294 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP1O00294 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP1O00294 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP1O00294 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP1O00294 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP1O00294 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP1O00294 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP1O00294 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP1O00294 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP1O00294 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP1O00294 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP1O00294 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP1O00294 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP1O00294 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP1O00294 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP1O00294 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP1O00294 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP1O00294 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP1O00294 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP1O00294 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP1O00294 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP1O00294 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP1O00294 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP1O00294 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP1O00294 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP1O00294 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP1O00294 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP1O00294 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP1O00294 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP1O00294 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP1O00294 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP1O00294 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP1O00294 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP1O00294 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP1O00294 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP1O00294 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP1O00294 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP1O00294 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP1O00294 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms