Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC44.89■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
SUPT5HO00267 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.84■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC44.84■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
SUPT5HO00267 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
SUPT5HO00267 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
SUPT5HO00267 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SUPT5HO00267 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
SUPT5HO00267 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
SUPT5HO00267 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
SUPT5HO00267 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC44.74■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC44.71■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC44.69■■■■■ 4.75
SUPT5HO00267 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.68■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
SUPT5HO00267 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
SUPT5HO00267 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms