Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MEN1O00255 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEN1O00255 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEN1O00255 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEN1O00255 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEN1O00255 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEN1O00255 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEN1O00255 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEN1O00255 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEN1O00255 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEN1O00255 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEN1O00255 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEN1O00255 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEN1O00255 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEN1O00255 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MEN1O00255 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MEN1O00255 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEN1O00255 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MEN1O00255 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEN1O00255 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEN1O00255 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEN1O00255 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEN1O00255 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEN1O00255 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEN1O00255 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEN1O00255 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MEN1O00255 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEN1O00255 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEN1O00255 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEN1O00255 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEN1O00255 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEN1O00255 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEN1O00255 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEN1O00255 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEN1O00255 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEN1O00255 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEN1O00255 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEN1O00255 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEN1O00255 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEN1O00255 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEN1O00255 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEN1O00255 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEN1O00255 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEN1O00255 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEN1O00255 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEN1O00255 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEN1O00255 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEN1O00255 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEN1O00255 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEN1O00255 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEN1O00255 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEN1O00255 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEN1O00255 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEN1O00255 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEN1O00255 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEN1O00255 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEN1O00255 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEN1O00255 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEN1O00255 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEN1O00255 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEN1O00255 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEN1O00255 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEN1O00255 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEN1O00255 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MEN1O00255 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEN1O00255 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEN1O00255 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEN1O00255 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEN1O00255 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEN1O00255 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEN1O00255 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEN1O00255 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MEN1O00255 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEN1O00255 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEN1O00255 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEN1O00255 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEN1O00255 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEN1O00255 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MEN1O00255 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEN1O00255 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEN1O00255 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEN1O00255 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEN1O00255 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MEN1O00255 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEN1O00255 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MEN1O00255 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEN1O00255 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEN1O00255 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEN1O00255 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEN1O00255 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEN1O00255 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEN1O00255 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MEN1O00255 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEN1O00255 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEN1O00255 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEN1O00255 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEN1O00255 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEN1O00255 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEN1O00255 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEN1O00255 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms