Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NFKBIEO00221 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NFKBIEO00221 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms