Protein–RNA interactions for Protein: O00178

GTPBP1, GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1O00178 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP1O00178 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTPBP1O00178 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTPBP1O00178 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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