Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPSO00116 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPSO00116 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPSO00116 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPSO00116 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPSO00116 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPSO00116 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPSO00116 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPSO00116 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGPSO00116 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGPSO00116 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGPSO00116 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGPSO00116 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGPSO00116 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGPSO00116 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGPSO00116 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGPSO00116 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGPSO00116 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGPSO00116 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGPSO00116 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGPSO00116 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGPSO00116 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPSO00116 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGPSO00116 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGPSO00116 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGPSO00116 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGPSO00116 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGPSO00116 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPSO00116 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPSO00116 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPSO00116 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPSO00116 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPSO00116 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPSO00116 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPSO00116 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPSO00116 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPSO00116 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPSO00116 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPSO00116 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPSO00116 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPSO00116 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPSO00116 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGPSO00116 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGPSO00116 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGPSO00116 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGPSO00116 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AGPSO00116 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPSO00116 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPSO00116 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPSO00116 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPSO00116 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPSO00116 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGPSO00116 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGPSO00116 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGPSO00116 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGPSO00116 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGPSO00116 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGPSO00116 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGPSO00116 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGPSO00116 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPSO00116 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPSO00116 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPSO00116 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPSO00116 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPSO00116 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPSO00116 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPSO00116 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPSO00116 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPSO00116 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPSO00116 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPSO00116 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPSO00116 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPSO00116 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPSO00116 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPSO00116 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPSO00116 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPSO00116 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPSO00116 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPSO00116 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPSO00116 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPSO00116 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPSO00116 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPSO00116 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGPSO00116 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGPSO00116 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGPSO00116 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGPSO00116 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPSO00116 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPSO00116 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPSO00116 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPSO00116 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms