Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28051J3QMA2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28051J3QMA2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms