Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ubap1lG3UW59 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ubap1lG3UW59 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ubap1lG3UW59 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ubap1lG3UW59 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ubap1lG3UW59 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ubap1lG3UW59 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms