Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r76F8VQ63 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vmn1r76F8VQ63 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r76F8VQ63 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.5 ms