Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox13F6YCR7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhox13F6YCR7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox13F6YCR7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms