Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Crocc2F6XLV1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Crocc2F6XLV1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Crocc2F6XLV1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Crocc2F6XLV1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Crocc2F6XLV1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Crocc2F6XLV1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms