Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf212F6TQD1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf212F6TQD1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms