Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28374F6SG70 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28374F6SG70 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms