Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm340F6RGI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm340F6RGI3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms