Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa27F2Z403 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa27F2Z403 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa27F2Z403 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa27F2Z403 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa27F2Z403 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa27F2Z403 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa27F2Z403 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa27F2Z403 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms