Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TrdnE9Q9K5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TrdnE9Q9K5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TrdnE9Q9K5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms