Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Simc1E9Q6E9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Simc1E9Q6E9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Simc1E9Q6E9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Simc1E9Q6E9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Simc1E9Q6E9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Simc1E9Q6E9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Simc1E9Q6E9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Simc1E9Q6E9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Simc1E9Q6E9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Simc1E9Q6E9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Simc1E9Q6E9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Simc1E9Q6E9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Simc1E9Q6E9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms