Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpfE9Q3P4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpfE9Q3P4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpfE9Q3P4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms