Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Chd2E9PZM4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Chd2E9PZM4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Chd2E9PZM4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Chd2E9PZM4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Chd2E9PZM4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd2E9PZM4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Chd2E9PZM4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Chd2E9PZM4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Chd2E9PZM4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms