Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc28a1E9PXX9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc28a1E9PXX9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc28a1E9PXX9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc28a1E9PXX9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a1E9PXX9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a1E9PXX9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a1E9PXX9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a1E9PXX9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms