Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r49D3Z6L3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn2r49D3Z6L3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn2r49D3Z6L3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms