Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
3425401B19RikD3Z1D3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
3425401B19RikD3Z1D3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
3425401B19RikD3Z1D3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
3425401B19RikD3Z1D3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms