Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam47eD3YWC7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam47eD3YWC7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam47eD3YWC7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms