Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CatipB9EKE5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CatipB9EKE5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CatipB9EKE5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CatipB9EKE5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CatipB9EKE5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CatipB9EKE5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms