Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf1bB9EJ57 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1bB9EJ57 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1bB9EJ57 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms