Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B8ZZF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B8ZZF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B8ZZF3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B8ZZF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B8ZZF3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B8ZZF3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B8ZZF3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B8ZZF3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B8ZZF3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B8ZZF3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B8ZZF3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B8ZZF3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B8ZZF3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B8ZZF3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
B8ZZF3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B8ZZF3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B8ZZF3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B8ZZF3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
B8ZZF3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B8ZZF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B8ZZF3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
B8ZZF3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B8ZZF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B8ZZF3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B8ZZF3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B8ZZF3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B8ZZF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B8ZZF3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B8ZZF3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B8ZZF3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
B8ZZF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
B8ZZF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
B8ZZF3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
B8ZZF3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B8ZZF3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
B8ZZF3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
B8ZZF3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B8ZZF3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B8ZZF3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B8ZZF3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B8ZZF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B8ZZF3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B8ZZF3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B8ZZF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B8ZZF3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B8ZZF3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
B8ZZF3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B8ZZF3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B8ZZF3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B8ZZF3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B8ZZF3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B8ZZF3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
B8ZZF3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B8ZZF3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B8ZZF3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B8ZZF3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B8ZZF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
B8ZZF3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B8ZZF3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B8ZZF3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B8ZZF3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B8ZZF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B8ZZF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B8ZZF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B8ZZF3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
B8ZZF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B8ZZF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B8ZZF3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
B8ZZF3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B8ZZF3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B8ZZF3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
B8ZZF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B8ZZF3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B8ZZF3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B8ZZF3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B8ZZF3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B8ZZF3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
B8ZZF3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B8ZZF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B8ZZF3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B8ZZF3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B8ZZF3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B8ZZF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B8ZZF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B8ZZF3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B8ZZF3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B8ZZF3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B8ZZF3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B8ZZF3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B8ZZF3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B8ZZF3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B8ZZF3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B8ZZF3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B8ZZF3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B8ZZF3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B8ZZF3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B8ZZF3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B8ZZF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B8ZZF3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms