Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ERVV-2B6SEH9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERVV-2B6SEH9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ERVV-2B6SEH9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERVV-2B6SEH9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERVV-2B6SEH9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms