Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phf11cB4XVP9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf11cB4XVP9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms