Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Znf518aB2RRF6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Znf518aB2RRF6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Znf518aB2RRF6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Znf518aB2RRF6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Znf518aB2RRF6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Znf518aB2RRF6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Znf518aB2RRF6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Znf518aB2RRF6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Znf518aB2RRF6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Znf518aB2RRF6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Znf518aB2RRF6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Znf518aB2RRF6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Znf518aB2RRF6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Znf518aB2RRF6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Znf518aB2RRF6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms