Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Brpf1B2RRD7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brpf1B2RRD7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brpf1B2RRD7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Brpf1B2RRD7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms