Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGB1P1B2RPK0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB1P1B2RPK0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms