Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ube2uB1AUC4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ube2uB1AUC4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ube2uB1AUC4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ube2uB1AUC4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ube2uB1AUC4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ube2uB1AUC4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ube2uB1AUC4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ube2uB1AUC4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms