Protein–RNA interactions for Protein: A8MYJ7

TTC34, Tetratricopeptide repeat protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC34A8MYJ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC34A8MYJ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC34A8MYJ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC34A8MYJ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC34A8MYJ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC34A8MYJ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC34A8MYJ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC34A8MYJ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC34A8MYJ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC34A8MYJ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC34A8MYJ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC34A8MYJ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC34A8MYJ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC34A8MYJ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms