Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VGLL3A8MV65 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VGLL3A8MV65 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VGLL3A8MV65 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms